研究重點
研究微菌叢對於消化系癌症、代謝症候群、罕見代謝異常疾病之角色，以及其致病機轉，並發展以微菌叢為核心的生物標記及介入策略。
以微菌叢為核心，研究上述疾病及其亞健康族群之多體學及表型組學，並建立其數位分身，以進行疾病的預測及預防。
以上述研究來發展精準健康的產、學、研之研發生態鏈，拓展從基礎到臨床、實驗室到病房照護、醫院到社區的產學創新研發價值。
近期論文發表
| 發表日期 | 作者 | 論文名稱 | 摘要 | 期刊名稱 | SCI Impact Factor |
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| 2026年1月19日 | 高正彥老師等 | Emergence of conjugative metallo-β-lactamase-encoding plasmids in the Klebsiella pneumoniae species complex: First identification of IMP-8-MCR-9.1 in K. quasipneumoniae and VIM-1 in K. variicola in Taiwan | 在 CRKpSC 分離株中，blaKPC 最常見（20.1%），其次為 blaOXA-48（3.4%），而 blaIMP、blaNDM、blaVIM 均相當罕見（≤1%），且僅極少數菌株同時帶有多種基因。僅有少數 Kq 與 Kv 菌株攜帶金屬β-內醯胺酶基因，其中 pNCKUH114–1 質體帶有 blaIMP-8 與 mcr-9.1，pNTUH73–1 則帶有 blaVIM-1，且與資料庫中已知質體相似度有限。這兩種質體僅能轉移至 E. coli EC359，且在實驗條件下並未增加其對幼蟲的致病力。 | Journal of Infection and Public Health | 4 |
| 2026年2月3日 | 高正彥老師等 | A combined genetic and phenotypic marker approach enables precise detection of hypervirulent Klebsiella pneumoniae and reveals associated traits of capsule overproduction and tellurite resistance | 本研究整合基因與表型分析，比較碳青黴烯抗藥性與肝膿瘍相關之Klebsiella pneumoniae菌株，發現五個毒力基因（peg-344、iroB、iucA、prmpA、prmpA2）結合string test可有效鑑定高毒力菌株（hvKp）。結果顯示，帶有五個基因的菌株無論string test是否陽性，皆具有較高毒力與莢膜產量，其中LAKp組別的致死性與莢膜生成最為顯著，而缺乏這些基因的CRcKp則表現最低毒力。長期監測亦發現血液分離株中攜帶五項毒力標記的比例高於尿液分離株，顯示這些生物標記有助於提升hvKp的臨床檢測與風險評估。 | Microbiol Spectr | 3.8 |
| 2026年2月27日 | 張婷婷老師等 | Inhibition of CCL4 prevents renal inflammation and fibrosis in acute kidney injury | 本研究探討趨化因子CCL4在急性腎損傷中的角色，發現抑制CCL4可減少腎臟發炎反應與後續纖維化程度，顯示CCL4可能是急性腎損傷併發腎纖維化的潛在治療標靶。 | Clinical Science | 7.7 |
| 2026年3月18日 | 張婷婷老師等 | CCL7 suppression alleviates vascular injury by blocking the CCR5/STAT1 signaling pathway in chronic kidney disease | 本研究探討慢性腎臟病中，發炎趨化因子CCL7在周邊動脈疾病發展中的角色，發現CKD小鼠血中CCL7濃度上升，並伴隨缺血肢體血流下降與傷口癒合延遲。抑制或剔除CCL7可促進新生血管生成、增加毛細血管密度並改善血流與組織修復，顯示其對血管再生具有負向調控作用。進一步機制研究指出，CCL7透過調控CCR5/STAT訊號途徑影響內皮細胞功能，因此可能成為CKD相關血管併發症的重要治療標靶。 | Life Sciences | 5.1 |
| 2026年3月24日 | 吳莉玲老師等 | Nfil3 integrates circadian rhythm and microbial metabolite signaling to maintain gut-liver immune-metabolic homeostasis under high-fat diet stress | 這些結果支持Nfil3作為一個關鍵調控節點，連結腸道菌相功能潛力與代謝相關脂肪性肝病（MASLD）中的免疫與代謝反應。儘管目前仍屬前臨床研究，本研究提供了一個機制性架構，說明腸道微生物相關的代謝重編程如何影響宿主的免疫與代謝恆定。未來仍需結合晝夜節律與代謝物層級的研究，以及人體介入試驗驗證，以釐清菌相–Nfil3軸在臨床上的實際意義。 | J Transl Med | 9.7 |
| 2026年4月 | 高正彥老師等 | Multidrug-Resistant Klebsiella pneumoniae in a Pediatric ICU: Emergence of Newly Identified ST7120 and the First Report of ST792 in Taiwan | 本研究描述某兒童加護病房自2021年9月至2022年8月間長達一年的多重抗藥性肺炎克雷伯氏菌群聚事件，發現新型別ST7120及台灣首例ST792，兩者均與長期定植及侵入性感染有關。其中兩例感染源自具碳青黴烯抗藥性的ST7120（一例死亡），另一例為產ESBL之ST792並導致嚴重神經學後遺症，顯示分子流行病學監測有助於及早發現與圍堵院內感染疫情。 | New Microbes New Infect | 5.4 |
| 2026年4月17日 | 吳俊穎老師等 | Rapid electrochemical profiling of fecal short chain acids using esterification/dissociation fingerprints and artificial neural networks | 本研究開發了一種快速又便宜的方法，可以檢測人體糞便中的短鏈脂肪酸（SCFAs），並結合人工智慧提高分析準確度。研究發現，這套方法即使面對複雜的糞便樣本，也能準確測量丙酸、丁酸等重要代謝物，結果與傳統 GC–MS 檢測幾乎一致。由於檢測速度快、設備成本較低，未來有機會應用於大量健康篩檢與長期腸道健康監測。 | Biosensors | 5.6 |
| 2026年5月8日 | 吳俊穎老師等 | Intratumoral microbial networks as biomarkers for second primary oral cancer risk in esophageal squamous cell carcinoma | 研究針對28位食道鱗狀細胞癌患者（其中8位併發第二原發口腔癌）的腫瘤檢體進行菌相定序分析，發現腫瘤內微生物網絡可有效區分是否併發第二原發口腔癌，其中以Prevotella pallens與P. scopos為核心的菌相模組與口腔癌風險密切相關，顯示腫瘤內菌相可作為預測第二原發癌風險之生物標記。 | Sci Rep | 4.9 |
| 2026年7月 | 張婷婷老師等 | Xaliproden improves diabetic kidney disease through JNK-mediated renal tubular protection | 本研究發現Xaliproden可透過調節JNK訊號路徑，對糖尿病腎病中的腎小管損傷提供保護作用，為糖尿病腎病的治療提供新的潛在藥物標的。 | Biochemical Pharmacology | 5.6 |
| 2026年4月6日 | 吳莉玲老師等 | Cumulative defined daily doses Enables Objective Assessment of Treatment Intensity and Outcome Prediction in IgG4-RD and Its subtypes | 不同的增生型與纖維化型表現具有差異性的風險與治療反應。透過定量評估cDDD（累積定義日劑量）可客觀反映治療強度並預測臨床結果。此方法有助於推動IgG4相關疾病的分期導向與精準治療策略。 | Rheumatology | 4.7 |